Nacido de una tradición, Naturalis (inaugurado en 1998) es un museo relativamente nuevo, pero con una historia rica. Fue fundado en el año 1820 como Museo Estatal de Historia de las Ciencias Naturales. Implicado activamente con la naturaleza, Naturalis es una institución científica. Durante casi dos siglos Naturalis ha coleccionado, estudiado y preservado especímenes animales, piedras, minerales y fósiles. Estos fondos se exponen al público desde el 8 de abril de 1998.

El museo forma un complejo sencillo junto con el existente Pesthuis (el museo de geología creado dentro de un edificio del siglo XVII y restaurado por Flip Roberts), el cual es ahora la entrada principal y la zona de servicios públicos. La naturaleza es exhibida, en todo su esplendor de color y formas, en un edificio moderno y tecnológicamente avanzado.

Y por supuesto no se ha olvidado a los niños, hay una ruta infantil estructurada con juegos de ordenador.

El diseño realizado por los arquitectos Fons Verheijen/WKH utiliza el elemento sorpresa en la larga conexión de la galería-puente, habitada por hipopótamos y tapados por una superficie de piel de cebra. La amplia entrada ofrece una vista singular del espacio interior al completo, incluyendo las galerías superiores (diseñadas por Donald Janssen), los esqueletos gigantes de dinosaurio, elefantes, delfines, etc.